Pyronin Y 与双链核酸 (尤其是 RNA) 形成荧光复合物,能够在流式细胞术中对细胞 RNA 进行半定量分析,以估计福尔马林固定的 EL4 白血病肿瘤细胞、酶分散的 R3327-G 大鼠前列腺腺癌中每个细胞的 RNA 含量细胞、用伴刀豆球蛋白 A 刺激的小鼠脾细胞和用植物血凝素刺激的人外周血淋巴细胞 [1]。
描述了基于 Pyronin Y 的荧光染色程序。该技术已用于对人网织红细胞中的 RNA 进行染色,用于后续的流式分析和分选 [2]。
在活细胞中,这种染料也会在线粒体中积累。浓度为 1.7 至 3.3 μM 时,Pyronin Y 几乎完全定位于培养细胞的线粒体中,类似于另一种线粒体探针,罗丹明 123。在该浓度下,Pyronin Y 没有毒性,但会抑制细胞生长,使细胞停滞 [3]。
Pyronin Y 长期以来一直与甲基绿等其他染料结合使用,作为石蜡组织切片中核酸的鉴别染色。Methyl Green-pyronin Y 染色切片中,红细胞、血管弹力纤维、胰腺腺泡细胞酶原颗粒、肝细胞表面膜和肾小管细胞均呈强烈的绿色和/或红色荧光,而细胞核出现非荧光 [4]。
Pyronin Y 结合双链 RNA (dsRNA),包括信使 RNA (mRNA)、转移 RNA (tRNA) 和核糖体 RNA (rRNA) [5]。