PCR扩增实验中
思以科 捷所成
不加缓冲液(Buffer)能行吗?
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PCR(polymerase chain reaction)技术称聚合酶链式反应技术,又称无细胞克隆技术,是一种在体外通过DNA聚合酶(如Taq DNA聚合酶)扩增特定DNA片段的技术,其主要依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物,其原理类似于DNA的天然复制过程。该技术由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成:
DNA变性(90℃-95℃):双链DNA在高温的作用下氢键断裂,形成单链DNA,以便与引物结合。
退火(50-60℃):温度降低,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合,形成局部双链。
延伸(70-75℃):DNA模板-引物在DNA聚合酶(如Taq DNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,从引物的5’端至3’端延伸,合成与模板互补的DNA链。
由上可知,
对于一个完整的PCR反应来说,
DNA模板、引物、dNTP
缺一不可。
那么PCR反应试剂中添加的Buffer起到啥作用呢?
★ 提供适宜的pH值环境:PCR缓冲液可以通过接受或释放氢离子来抵消强酸和强碱对溶液pH的影响,进而维持酶活性所需的最适宜pH值,确保酶在反应过程中保持最佳活性状态,提高扩增效率。
★ 调节金属离子浓度:PCR反应中,金属离子如镁离子(Mg2+)是必需的,其能够结合到酶-底物结合体上,降低催化反应的活化能,使得反应能够顺利进行。但Mg2+浓度过高可降低PCR扩增的特异性,浓度过低则影响PCR扩增产量,甚至使PCR扩增失败。缓冲液可以有效调节金属离子的浓度,保持PCR反应的特异性,减少非特异性扩增产物的生成,提高PCR反应的准确性。
★ 抑制DNase活性:在PCR反应前,通常需要对DNA样品进行提取和纯化,此过程中DNA可能会受到污染、损伤,或者残留有DNA酶。适宜的缓冲液可以在一定程度上抑制DNase活性,有效保护DNA的完整性,减少PCR反应的非特异性降解。
★ 适应不同实验条件:根据实验需要,可以通过调整缓冲液的浓度来优化PCR反应。此外,某些缓冲液还可以与其他缓冲液混合使用,以适应特定的实验要求,提供更大的操作灵活性。
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